Войтенко является самым титулованным баянистом России и чемпионом мира по баяну.
С 1988 года Сергей Войтенко сыграл более 3000 концертов как в сольном исполнении, так и с известными мировыми оркестрами.
Так же Сергей Войтенко занимается композиторской деятельностью. Он написал более 100 произведений для баяна соло и с оркестром. А написанные им песни исполняют Лев Лещенко, Денис Майданов, Академический ансамбль песни и пляски войск национальной гвардии РФ, Ансамбль песни и пляски ВДВ России, Центральный пограничный ансамбль Федеральной службы безопасности Российской Федерации, Кубанский казачий хор.
Яркой страницей творческой биографии артиста являются выступления на торжественных мероприятиях перед главами государств и Президентом России. Он исполнял произведения в культурных программах международных форумов, в том числе на саммитах Большой Восьмерки и Большой Двадцатки, зимних Олимпийских играх.